平行志愿的投档原则仍为“分数优先，遵循志愿”，而传统的顺序志愿则是根据“志愿优先，按分排序”。
平行志愿的投档原则仍为“分数优先，遵循志愿”，而传统的顺序志愿则是根据“志愿优先，按分排序”。分数优先是指：平行志愿首先按照考生总成绩从高到低分类(文科、理科、文体类)排序，计算机按照顺序依次检索，首先检索第一名考生的院校志愿，若第一名投档或者滑档，则检索第二名考生院校志愿，依次类推。
注意：平行志愿填好后就不可更改，在甲乙两人总分相同时，按照文综(理综)成绩高低区分，必须排出先后顺序，各省市具体规则有可能不同。
平行志愿中遵循志愿是指：计算机检索到某考生时按照其院校志愿顺序依次检索(ABCDE)，检索到某志愿一旦符合投档条件即向高校投档。平行志愿中的一轮投档是指：考生档案一旦投出,计算机不再检索后续院校志愿，也就是说该生无论能否被录取，其他志愿高校失效，都不会再进行检索，只有一次投档一次，只有一个志愿发挥作用。
平行志愿的优势实行平行志愿后，每批考生可同时选择A、B、C 3个或A、B、C、D、E 5个学校，录取投档时，“分数优先，遵循志愿”。第一步：按考生成绩从高到低顺序排序，比如最高分是700分，则先投700分的考生，再投699分的考生，再投698分的考生……以此类推。
第二步：每个考生投档时，按志愿中先A学校，再B学校，再C学校的顺序检索，如考分够A学校，就投档到A学校，如不够，则看B学校，以此类推……这样就相当于考生一次选择了3个或5个第一志愿，扩大了考生选择范围。
对未被平行院校志愿录取的考生，还可以再参加征求平行志愿的填报，使考生拥有了更多的录取机会，在一定程度上降低了考生填报志愿的风险。
平行志愿的填报要点鉴于平行志愿的投档原则，我们填报平行志愿时既要讲究梯度也要注意搭配和排序。建议把握以下几个要点。
第一，平行志愿虽然是平行的，但同样是有顺序的。有人片面认为平行志愿没有顺序，几所院校都一样，这是不对的。录取时是按照考生自己填报的顺序依次进行检索。因此，一定要把最想去的院校放在最前面。
第二，平行志愿的几所院校一定要有梯度。第一所院校的录取分数可以高一些，往后要按照院校今年可能的录取分数梯次降序排列。否则，若第一所院校录取不上，后面几所院校有可能都录取不上，成为无效志愿。
第三，平行志愿的倒数第1、2所院校一定要保底。各省实行平行志愿的批次大都只有一个志愿顺序，不再设置后续志愿。如果在平行志愿这个志愿顺序上保不住底，在本批次就只有征求志愿的机会了。
