应用化学专业原为精细化工专业，始建于1980年，1986年获得硕士学位授予权，是原轻工总会部级重点学科，所属实验室是部级重点实验室;2002年评为北京市重点学科，现为北京市品牌建设专业，每年招收两个自然班的本科生。
本系具有一支结构合理的教学科研师资队伍，目前拥有专任教师17人，实验员5人，其中教授8人，副教授7人，讲师2人，具有博士学位者16人(其中博士后2人)，占教师总数72%，35岁以下教师占教师总数32%，目前已形成了一支以中青年教师为主、学历层次高、职称结构合理的学术梯队。目前拥有北京市学术创新团队1支、北京市优秀教学团队1支;拥有中国工程院院士1人、百千万人才工程国家级人选2人、百千万才工程北京市级人选1人、省部级有突出贡献专家1人、北京市高校青年学科带头人1人、北京市跨世纪优秀人才工程入选者1人、北京市高校高层次人才1人、北京市长城学者1人，北京市拔尖创新人才1人、北京市学术创新人才1人、北京市高校中青年骨干教师3人、北京市青年拔尖人才2人。多人在精细化工领域、食品添加剂领域重要学术团体及学术期刊担任兼职，在相关的行业具有很高的知名度和影响力。
主要研究方向有：香料化学及其应用、表面活性剂合成及应用、化妆品及其原料、洗涤剂及其助剂、医药中间体合成和精细化学品分析与检测等。主持完成国家“973”、“863”、国家科技支撑计划(攻关)项目、国家自然科学基金课题等国家级科研项目40余项，省部级科研项目数十项，企业委托项目100余项。科研成果获得国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖3项，省部级科技奖励10余项。
拥有约1000平米专业实验室和核磁共振仪、液-质联机、气-质联机、气-红联机、电子鼻、电子舌、超临界流体色谱仪、高效液相色谱仪、中低压色谱仪、气相色谱仪、薄层扫描色谱仪、红外光谱仪、在线红外光谱仪、表面张力仪、接触角测定仪、泡沫扫描仪、纳米粒度仪等大型分析仪器，以及超临界流体萃取设备、微波萃取仪、加速溶剂萃取仪、微波合成仪等大型设备，为教学科研提供坚实的硬件基础。与很多国内大型企事业单位具有友好的合作关系，在北京洛娃集团、北京天利海香精香料有限公司、北京味食源生物技术有限公司等企业建有教学实践基地，供本系学生参观实习。
